LI-6800数据分析 | 文章的图形和照片的拼接也可以用 R 啦

LI-6800高级光合-荧光测量系统

在文章中难免有太多需要拼图的地方，例如作图的时候直接将几幅图拼在一起，这种方式的拼图比较好处理，有大量的软件包做这个事情，例如优秀的 patchwork，还有一种就是实验的拍照，需要拼图，或者拍照和作图拼在一起，这种方式我们通常都手动处理，实际上，现在在 R 里也有解决方案了，那就是今天要介绍的 figpatch 软件包，与 patchwork 是绝配。

安装

安装很简单，从 CRAN 即可，现在 github 不是那么好用：

要使用还是必须进行一如既往的操作：

使用

我这里使用两次 RACiR 测量的数据，因为这两个数据来源于水稻，所以我网上随便找了两个水稻的图片，当做两次测量的植株处理。

先将数据读入：

后面简化操作步骤，用 ggplot2 默认的 loess 方式拟合一下数据，不再进行一个非线性拟合后在写入公式。

与作图数据进行拼图

实际上测量时水稻是种在温室里相邻的两个水池内，长势也一致，这里只是作为演示用，所以不要误会。

拼图时图形我们可以设置长宽比，方便我们调整图形的外观，例如下面三个例子：

标签

作为标准的科研图形，加标签很重要：

拼接照片

拼接照片也很方便：

拼接多个图片

如果有大量的图片，可以先把他们拼接成向量或列表，以及利用相关参数调整边距等

添加特定文本

figpatch 实际上是对图片进行 ggplot2 包裹，他的 fig() 实际上是 ggplot 对象，labels则是坐标轴 (x 或 y)。因而可以根据这个来定制特定文本的显示。

参考资料链接